Le Centre Médical SOS Bujumbura est opérationnel depuis juillet 1992. Sous le financement de la Coopération Technique Belge (CTB) en 2008, le Centre Médical a été réhabilité et offre le paquet minimum d’activités conformément aux normes du Ministère de la Santé Publique et de la lutte contre le VIH/SIDA.
Il compte 10 services au complet à savoir : le Service de Consultations externes, Hospitalisation, Petite chirurgie, Laboratoire, Pharmacie, Maternité, le service préventif (Vaccination, planning familial, consultation prénatale), le service de prise en charge du VIH, le service de la prise en charge de la tuberculose ainsi que le service Secrétariat – comptabilité.